拼多多商家被投诉时，特殊情况或例外情形会影响处理结果：
1、投诉方撤诉：处理中若投诉方因商家沟通解决问题而主动撤诉，商家可免平台处罚及法律纠纷，只需提交撤诉凭证给平台，投诉流程即结束，对店铺信誉影响最小。
2、投诉内容涉及重大违法违规：若投诉涉及售假、欺诈等重大违法违规，平台可能移交市场监管部门，商家不仅面临平台处罚，还可能遭罚款、没收违法所得，情节严重者追究刑事责任，对经营打击巨大。
3、平台存在误判：若因系统故障或信息不对称误判，商家需提供充分证据申诉。申诉成功则平台撤销处理结果，恢复权益；失败则需通过其他法律途径维权。